Pelaksanaan Program Bantuan Operasional Sekolah Tahun 2012 diatur dalam 3 Peraturan menteri yaitu Permendagri No. 62 tahun 2011 yang mengatur penganggaran, pelaksanaan dan penatausahaan dan pertanggungjawaban BOS; Permendikbud No. 51 tahun 2011 yang mengatur teknis penggunaan dana BOS tahun 2012; dan Permenkeu No. 201/ PMK.07/2011 yang mengatur mekanisme penyaluran dana BOS dari Kas UmumNegara ke Kas Umum Daerah serta pelaporannya
Tidak kurang dari Rp 23,594 triliun dialokasikan untuk dana BOS. Sementara itu, untuk mengantisipasi jumlah siswa yang belum terhitung atau bertambahnya siswa dari perkiraan semula maka disiapkan dana cadangan BOS (buffer fund) sebesar Rp. 1,153 triliun. Sekolah penerima dana BOS meliputi SD/SDLB dan SMP/SMPT, termasuk SD-SMP Satu Atap  (SATAP) dan Tempat Kegiatan Belajar Mandiri (TKBM) yang diselenggarakan oleh masyarakat.

SKEMA DANA BOS

BOS SD diberikan untuk 28.006.000 siswa dengan alokasi sebesar Rp 580.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 16.243.480.000
 
BOS SMP  diberikan untuk 10.354.000 siswa dengan alokasi sebesar Rp 710.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp   7.351.340.000

Rintisan BOS SMA diberikan untuk  4.105.139 siswa dengan alokasi sebesar Rp 125.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 513.142.375

Rintisan BOS SMK diberikan untuk 3.800.000 siswa dengan alokasi sebesar Rp 125.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 475.000.000

SKEMA DANA SUBSIDI

Subsidi Penyelenggaraan Pendidikan Khusus diberikan untuk 106.185 siswa dengan alokasi sebesar Rp 814.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 86.413.595

Siswa SD Penerima Subsidi Miskin sebanyak 3.530.305 siswa dengan alokasi sebesar Rp 364.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 1.285.031.000
 
Siswa SMP Penerima Subsidi Miskin sebanyak 1.295.450 siswa dengan alokasi sebesar Rp 600.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 777.270.000

Siswa SMA Penerima Subsidi Miskin sebanyak 505.290 siswa dengan alokasi sebesar Rp 787.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 397.782.940

Siswa SMK Penerima Subsidi Miskin sebanyak 617.576 siswa dengan alokasi sebesar Rp 786.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 485.414.736

Subsidi Mahasiswa Berprestasi dari Keluarga Tidak Mampu sebanyak 180.000 mahasiswa dengan alokasi sebesar Rp 4.200.000 per siswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 756.000.000

SKEMA DANA BEASISWA

Beasiswa Bidik Misi bagi Angkatan Baru dengan rincian
Beasiswa untuk sejumlah 30.000 mahasiswa dengan alokasi sebesar Rp 6.000.000 per mahasiswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 180.000.000.000
Biaya Kedatangan bagi 15.000 mahasiswa dengan alokasi sebesar Rp 1.5000.000 per mahasiswa per tahun membutuhkan anggaran sebesar Rp 225.000.000.000
Biaya Pendaftaran bagi 100.000 calon mahasiswa dengan alokasi sebesar Rp 175.000 per mahasiswa membutuhkan anggaran sebesar Rp 17.500.000.000

Beasiswa Bidik Misi bagi Mahasiswa On Going diterima oleh 50.000 mahasiswa dengan alokasi per sebesar Rp 12.000.000 per mahasiswa membutuhkan anggaran sebesar Rp 600.000.000.000 (*)